兄妹关系合法，兄妹有婚姻关系不合法。兄妹关系是客观存在的，就是一个父母，没有啥不合法的，所以这个问法就不明白兄妹关系的含义，兄妹不能有婚姻关系，因为婚姻法明确规定，三代以内旁系血亲和血亲都不能结婚，这是为了预防遗传病的发生。
兄妹关系在法律上是合法的，是有至亲的血脉相连，亲如手脚。
但是我国法律有明文规定兄妹不能通婚，近亲组成家庭对下一代是有害的，很大概律生下有缺陷的小孩，如（白痴，小儿麻痹，头大，五官大小不配等怪小孩，病小孩）这样的婚姻是对下一代极为不负责的。所以为了下一代是不允许兄妹不可以通婚，连三代有血脉关系的至亲在我国法律上都是不允许结婚的。
如果是有血缘关系兄妹(直属三代之内)有关系是不合法的。国家有文明规定七夕，目的为了子孙后代健康考虑。兄妹有血缘关系(直属三代之内)结婚之后的后代出现畸形婴儿机率非常高。
如果是年龄相差大小成为兄妹的(没有血缘关系)，是合法的，只要志同道合的，可以结婚的。