燃气热水器过热保护故障的排除方法如下：
1、水压过低或出现异常：恢复正常水压。
2、燃气供应异常：检测燃气供应是否正常，及时打开燃气供应。
3、热熔断器的组件连线部分是否脱落或者接触不良：重新插好插件或焊接连接。
4、温控器接线不良或损坏：更换温控器。
5、燃气比例阀损坏：更换燃气比例阀。
6、开关阀电磁阀损坏：更换开关阀电磁阀。
7、水流量传感器和感温探头是否异常或损坏：更换即可。
8、机电零部件连接线脱落或接触不良或卡死：重新插好插件或焊接连接。
9、机电异常、失控或损坏：更换机电即可。
10、主控制板故障：更换主板。