北京市供销合作总社是全市供销合作社的领导机构和市级社社有资产的管理机构，主要履行系统行业指导和市级社社有资产出资人代表职能。成立近六十年来，已形成了独立的、比较完整的经营管理服务体系。市社系统由市社、区（县）供销社、基层供销社三级组成，是自下而上的经济联合关系
其实正宗的供销社只有一家。都是全国供销合作总社的地方组织。下设的都是基层社和门市部。人们习惯把零售门店都叫供销社，而实际上供销社是有组织的。
北京市供销社实行三级所有管理体制，即市社本级社、区县社和基层社。市社系统设有10个区县级供销社、38个基层供销社、2家区物资回收公司，市社直属经营单位16个、学校2所。