天然水晶又称石英石，在中国最古老的叫法是"水玉"，意谓似水之玉。佛书中则称莹洁晶光的水晶为"水之精灵"，认为水晶会闪烁神奇的灵光，可普渡众生，尊称水晶为"菩萨石"。 水晶在一定温度和压力的自然环境中结晶而成，成分是二氧化硅。颜色多为无色透明（少量因结晶过程中，环境变化而混入杂质，形成紫色、茶色、绿色、金丝状、珊瑚状等不同形态），硬度大约在6-8左右，熔点1713℃，纯净的天然水晶体是最佳的光学材料。今天，因水晶体内的包裹物千姿百态、形象生动而极具观赏、收藏价值。
天然水晶的作用：
一、天然水晶具有特殊的"压电效应"。无缺陷的水晶单晶经加工成饰品佩带人体后，与代人体摩擦可以产生微弱的电磁场，这种电磁场具有稳定情绪、促使人体能量集中营，减轻病人痛苦和紧张，回忆痊愈速度等功能。如美国研究中心所推崇的"水晶疗法"，就是将水晶按压在病人伤患处起辅助治疗作用的。
二、从水晶的光学特性看，水晶属三方晶系的一轴晶正光性结晶体，有三个方向的光轴，当按方位精工切削琢磨后，光轴方向往往会产生一定聚光、放光功能，当其刺激到人体某一穴位时，可以产生一定的理疗作用，国外报道的用水晶治疗少儿骨折、乳腺癌等均基于这一道理。
三、从生物地球化学观点来看，水晶同其它宝石一样，形成于特殊的地质构造环境，含有部分对人体有益的微量元素，如铁、铜、锰、钛、锌、镍、钻、硒等，烟水晶由于形成时受到地下放射性照射而保留有少量放射性元素（含量极微，不会对人体有害，反而类似放射疗法），这些微量元素通过与人体的经常摩擦而会沿毛细孔汗腺等浸入到人体内而促进体内微量元素平衡，使身体各部分更加协调。
天然水晶和人工水晶的区别：
天然水晶是一种以二氧化硅为主要元素的天然磁石（二氧化硅），又称"透明的石英"。天然水晶在经过地球千万年的锤炼之后，蕴藏着巨大的能量波，在许多领域都功效显着，堪称"神奇之石"。天然水晶的美丽在不经意间吸引了珠宝设计师的眼球，而后迅速渗透整个装饰领域，成为人们装饰，观赏，收藏甚至是保健的首选。纯净的水晶为无色的透明晶体，而没有杂质的天然水晶几乎找不到，天然水晶大都含有气泡，杂质，晶体混浊。
合成水晶（熔炼水晶）：又称人造水晶，是原料石英砂经过一系列工序提炼，添加进金属元素（如铅）增强光的折射，再经精细的切割技术和绝无瑕疵的打磨功夫制造而成，晶体纯净透明，弥补了天然水晶的不足。由于人造水晶工序繁杂，有的售价甚至比天然水晶还要昂贵。
天然水晶：是在地低经过千百万年自然形成的结晶体而合成水晶则一般是用hydrothermal热水法制成，利用高温高压慢慢冷却而得。对于常玩水晶的人来说，比较注重水晶代表的意义。他们认为水晶是有能量的东西，不同的水晶有不同的灵性。天然水晶因其难得而价格比较贵一些，但是人们往往认为天然的水晶因其经过千百万年才形成（比人类的历史长得多），会包含天地之灵气，灵性要更强一些。至纯的天然水晶几乎没有，即使有的话也会非常昂贵。合成水晶可以造的非常纯，但意义上就差一些了。但人造水晶除了纯度高外，可以制作成各种形状的工艺礼品，又注入了新的色彩，这是天然水晶无法比拟的。
养殖水晶：通常是在一个大的压热器中放一台高精密度的熔炉，然后把天然水晶石英碎片放到温度和压力不断升高的水中进行分解。但主要的原料还是一块高质量的天然水晶，如果没有它，整个程序就无法启动生产者只需将这块精心挑选出来的天然水晶悬挂到压热器里面，其他的事，就是要等着它们自然而然的发生发展。周围液体很统一流到原始水晶上。等到水晶达到了要求的尺寸，就把它移开或是拿出来。这些新造出的水晶，虽然是天然水晶生长了一代又一代的结果，但仍然和在大自然培育出来的原始天然水晶一样纯净。 养殖水晶的成分与天然水晶是一摸一样的。（包括分子式）
所以不管是天然水晶和合成水晶，它们都是具有大自然原始的纯净，现在的人大多对这些有点误区，总认为合成的就是不好的，其实不然。
虽然普通水晶以天然为好、为贵，但值得注意的是昂贵的着名的奥地利水晶品牌施华洛世奇的水晶却全部都是人工合成的。
天然水晶的重要标志是：棉体和冰裂，但是极品的天然水晶通常的判断标准是，棉体肉眼几乎看不到，冰裂是绝对不能有的。这只是对水晶晶体的一种辨别的方法，如果说是价值评估的话，那还是要看水晶是否被赋予历史及文化了。
天然水晶的养护与消磁
无论你把水晶作为饰物、摆设或使用水晶的力量，均需要先清洗水晶，然后才可以有效地运用。因为水晶从开采那一刻直到你手中，途中经过不同人接触，水晶会将他们的思想、运气及身体状况完全记录下来。所以我们要先把所有记录清除以便输入自己的信息。这样使用水晶时，便不会受前人影响。
清洗可称为消磁、净化。现在让我们介绍最简单也最多朋友使用的方法。
★ 阳光消磁法
找一个风和日丽的好天气，晒得到太阳又安全不会被偷或被小孩子宠物碰到的地方（如阳台、窗边等），将用矿泉水或过滤水洗净的水晶放置在阳光下晒，尤其正午时的阳光最好，晒上半天就可以了，此法除了净化同时还能帮晶品充电。
但提醒大家，若是有色的水晶，如粉晶、紫晶，最好不用阳光消磁法，因高温易改变内之分子结构，色泽容易变淡变白，就比较可惜。最适合用阳光消磁法的是白晶、黄晶、茶晶、发晶等较耐高温的晶石。
★ 粗盐消磁法
所谓粗盐就是指还未精制前的天然海盐，将海盐放在器皿中（最好避免用塑料，压克力等化工合成材质）， 玻璃，瓷碗都可以，加入矿泉水或过滤过的清水，最后再放入晶石，水量盖过晶石即可或者直接盖以粗盐，二十四小时后，将水晶拿出冲洗干净放置阳光（阴凉处）下三，四小时，让它回复生命力，这清洁原理是海盐本身有吸纳杂质，清洁的功用！可以配合阳光或月光消磁法是事半功倍，除了净化还能充电。
不过，此法较不适用于镶有金属环扣的水晶坠子或其它水晶饰品，因盐份会腐蚀金属及线绳，影响美观外也容易导致金属锈蚀松脱或绳线断裂，要特别小心。还有一些硬度比较低的软性宝石如方解石及有机宝石如珊瑚，琥珀等也不适用较适用于未经琢磨的小晶石。用过的粗盐水已经充满先前浸泡水晶的负面能量，最好不要再拿来净化别的水晶，这样是会有反效果的哦！
★ 大自然消磁法
利用大自然的力量消磁，水晶很喜欢自然的力量。若出外旅行，到一些山明水秀的地方，举凡山泉，瀑布，溪流，海边，只要是不受污染的水边，就可以将水晶泡到水里面，利用大自然的力量，帮水晶净化充电。