首先在测站进行设站，输入测站点坐标，再输入后视定向点坐标，仪器产生了坐标方位角，然后照准后视点按确定键，仪器坐标方位角确立成功。
在放样模式下输入待放点坐标值，产生仪器到待放点方位角差，旋转仪器使方位差为零，在视线上测棱镜，使仪器到待放点距离差为零，放样完毕。
首先，对中整平，有两种形式:光学对点器和激光对点器+电子精平。
其次，根据工作的不同，选择相应的程序，例如数据采集和放样等。具体工作步骤以放样为例:文件建立、测站设置（测站点号、坐标、高程）后视点设置（后视点号、坐标、高程）、确定、检核、开始放样。
其他的一些设置如照明、棱镜常数、对比度等，可以相应的进行设置。
最后，全站仪的使用过程中要注意仪器的安全防护，定期清洁、鉴定。